W Katedrze Fitopatologii Leśnej były realizowane dwa tematy zlecone przez Generalną Dyrekcję Lasów Państwowych:
- Próba zastosowania biopreparatu HF opartego na izolacie Hypholoma fasciculare do zabezpieczania pniaków drzew liściastych przed Armillaria spp. (1998 - 2000)
- Określenie czynników wpływających na zagrożenie chorobowe drzewostanów ze strony opieniek oraz sposobów przeciwdziałania im (wspólnie z Instytutem Badawczym Leśnictwa; 1999 - 2001)
Ponadto pracownicy Katedry prowadzą badania na terenie:
- RDLP Białystok
- RDLP Katowice
- RDLP Lublin
- RDLP Piła
- RDLP Poznań
- RDLP Radom
- RDLP Szczecin
- RDLP Toruń
- RDLP Wrocław
- LZD Siemianice
- LZD Zielonka
- RDLP Gdańsk
- RDLP Szczecinek