Cytometr przepływowy (sorter komórkowy) BD FACS Aria™III firmy Becton Dickinson wyposażony w 4 lasery (375 nm, 405 nm, 488 nm oraz 633 nm) pozwala na jednoczesny pomiar 13 parametrów komórek i cząstek biologicznych (11 kanałów fluorescencji oraz detektory: forward i side scatter). Cytometr przepływowy umożliwia analizę komórek (Procaryota i Eucaryota), endospor bakteryjnych, liposomów oraz mikropęcherzyków. Cytometria przepływowa jako metoda pomiaru pojedyńczych komórek jest w stanie zobrazować złożoność i różnorodność populacji mikroorganizmów. Pozwala uzyskać statystycznie istotne dane o zróżnicowaniu struktury populacji mikroorganizmów z wyodrębnieniem poszczególnych sub-populacji. Analizowane parametry komórek można podzielić na: strukturalne (integralność błony i ściany komórkowej, obecność specyficznych cząsteczek na powierzchni komórek, różnice w strukturze ściany komórkowej) i funkcjonalne (aktywność metaboliczna, potencjał błonowy lub aktywność komórkowych proteaz). Urządzenie umożliwia również izolację komórek ze zdefiniowanych sub-populacji (sortowanie zbiorcze lub pojedynczo-komórkowe) do probówek (cytometrycznych lub typu Eppendorf), na szkiełka mikroskopowe, płytki Petri’ego oraz na płytki 96- i 384-dołkowe. Cytometr wyposażony jest ponadto w system anty-aerozolowy zapobiegajacy kontaminacji powietrza w trakcie sortowania.
Z punktu widzenia profilu Katedry Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności UP w Poznaniu istotne jest wykorzystanie cytometru przepływowego (sortera komórkowego) w badaniach mikrobiologicznych. Główne kierunki aplikacji urządzenia to: i) badanie zróżnicowania strukturalnego i funkcjonalnego mono-kultur oraz złożonych populacji mikroorganizmów z próbek hodowlanych i środowiskowych, ii) specyficzna detekcja mikroorganizmów niehodowlanych (VBNC) w próbkach środowiskowych oraz pochodzących z linii technologicznych w przemyśle spożywczym, iii) sortowanie komórek mikroorganizmów w celu szczegółowej charakterystyki szczepów pochodzacych z izolatów środowiskowych, iv) ocena efektów modyfikacji genetycznych i selekcji transformantów z zastosowaniem białek reporterowych, v) ocena wpływu warunków stresowych na parametry fizjologiczne mikroorganizmów w celu optymalizacji warunków procesowych oraz doboru szczepów pod kątem wydajności fermentacji.